正常育龄妇女，在内分泌激素的作用下，阴道上皮细胞增生，其表层细胞含有丰富的糖原，非常有利于乳酸杆菌的生长，占阴道中细菌总数的90%以上。这种乳酸杆菌大量存在，就抑制了其他致病菌的生长，在阴道形成了一个正常的生态平衡。当人体雌激素水平下降，导致阴道上皮萎缩，细胞糖原减少，不利于乳酸杆菌生长。大量使用抗生素或用碱性液体过度冲洗阴道，抑制乳酸杆菌的生长。性乱、性交频繁(因精液pH为7.2-7.8)等导致致病性厌氧菌和加德诺菌大量繁殖，引起阴道微生物生态平衡失调，乳酸杆菌减少，最终导致细菌性阴道病。细菌性阴道病是指阴道内正常产生的乳酸菌减少，代之以另外一些细菌，例如加德诺杆菌、类杆菌、普氏杆菌、支原体等，破坏了正常的阴道酸性环境，阴道的pH上升到5.5左右。由于厌氧菌产生的脱羧酶，可激发加德诺菌产生某种氨基酸，产生挥发性胺类，释放出难闻的鱼腥臭味，胺类使pH升高，又抑制乳酸杆菌繁殖，，粘附有细菌的阴道表皮细胞脱落，使阴道分泌物增加，从而导致本病。由于菌群紊乱，阴道炎症并不明显，分泌物中自细胞减少，因此称细菌性阴道病(BV)比阴道炎更恰当。这与滴虫性阴道炎、老年性阴道炎等明显的阴道炎症不同。频繁、混乱的性生活成为细菌性阴道病的主要传播途径。而生殖道感染的存在及较差的卫生条件，则为该病的促发因素。
细菌性阴道病在妇科门诊患者中可占1/3左右，与性活活跃、性乱交有关。细菌性阴道病是造成早产、胎膜早破、低体重儿的主要原因。细菌性阴道病是导致阴道假丝酵母菌病和滴虫感染的主要原因，是造成输卵管炎、子宫内膜炎、盆腔炎、泌尿系感染、术后感染的危险因素，是发生不孕症、宫外孕和妇科肿瘤的有关原因。
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